系統性文獻回顧

適用情境

• 開始新研究專案 | 撰寫 Introduction 前調查 | 系統性回顧 | PICO 臨床問題
• 不適用：快速查一篇 → 直接 search_literature | 只需整理 → format_references

工具速查

pubmed-search MCP

mdpaper MCP 儲存文獻

✅ save_reference_mcp(pmid="12345678", agent_notes="...")
❌ save_reference(article={metadata})  # Agent 可能幻覺

工作流程

Phase 0: 環境準備

get_current_project()  # 確認專案
讀取：projects/{slug}/.memory/activeContext.md  # 了解之前做了什麼

Phase 1: 建立搜尋策略

關鍵字搜尋（一般主題）：

generate_search_queries(topic="remimazolam sedation ICU", strategy="comprehensive")

PICO 搜尋（比較性問題）：

# Step 1: 解析 PICO
parse_pico(description="remimazolam 在 ICU 鎮靜比 propofol 好嗎？")
→ P=ICU patients, I=remimazolam, C=propofol, O=sedation

# Step 2: 並行取得各元素 MeSH（同時呼叫！）
generate_search_queries(topic="ICU patients")
generate_search_queries(topic="remimazolam")
generate_search_queries(topic="propofol")

Phase 2: 並行搜尋執行

# 同時多組搜尋（並行呼叫！）
search_literature(query='"Intensive Care Units"[MeSH] AND remimazolam', limit=50)
search_literature(query='remimazolam AND propofol AND sedation', limit=50)

# 合併結果
merge_search_results(results_json='[{"query_id": "q1", "pmids": ["123"]}, ...]')

Phase 3: 結果評估

# 結果太少 (<20) → 擴展
expand_search_queries(topic="...", current_results=15)

# 對種子文獻做引用網路探索
find_citing_articles(pmid="12345678")   # forward
find_related_articles(pmid="12345678")  # similar
get_article_references(pmid="12345678") # backward

# 取得引用指標排序
get_citation_metrics(pmids="last", sort_by="relative_citation_ratio", min_rcr=1.0)

Phase 4: 篩選與儲存

# 呈現篩選清單給用戶（標題、年份、期刊、RCR）

# ✅ PRIMARY：使用 MCP-to-MCP 驗證
save_reference_mcp(pmid="12345678", agent_notes="Key paper on...")

# ⚠️ FALLBACK：僅當 API 不可用
save_reference(article={metadata}, project="...")

Phase 5: 匯出

format_references(style="vancouver")
prepare_export(pmids="last", format="ris")
analyze_fulltext_access(pmids="last")

Phase 6: ⭐ 更新專案記憶

# 必須更新！
寫入：projects/{slug}/.memory/activeContext.md
- Current Focus: 文獻回顧進度
- Key References: 關鍵文獻及重要性
- Memo / Notes: Agent 對文獻的觀察

決策點

常見問題

相關技能

• concept-development – 發展研究概念
• parallel-search – 並行搜尋細節